卡片系统在《太阁》系列中占有举足轻重的地位，游戏中的各种工作全都需要卡片来完成。玩家收集到的卡片可以在“札一览”菜单中详细察看，分为“主人公”、“称号”、“名所”、“秘技”、“合战”和“其他”6大类。

主人公卡片：初次进入《太阁5》的玩家一定会发现人物好少，只能扮演5个角色。但是随着玩家游戏，玩家会收到“主人公”卡片，每收到一个，玩家就多了一个可以选择的人物，总共有860个人物。

称号卡片：称号卡片需要玩家在游戏中通过达成一些成就来得到，一般都是靠精通某个技能得到的，不同的称号可以给玩家带来不同的效果。

名所卡片：名所卡片是纯粹的收集性卡片，玩家在游戏中周游日本全国，在不同的名胜处就可以得到对应的卡片。

秘技卡片：秘技是玩家可以使用的技能，有比武使用的，有辅助玩家作战的，有忍者潜入用的等等。有了他们玩家的战斗、潜入等活动会如虎添翼，主要的获得方法是学习。

合战卡片：合战，就是在战争中使用的卡片，其中有各种妙计，也有各种强力的攻击策略，这些卡片只有亲身参与到战场上的角色才能有机会使用，获得方法主要也是靠学习。

其他卡片：还有一些卡片被分为其他类，功能比较杂乱，其中不乏一些实用的卡片。

游戏中卡片总数的急剧增多，人物卡随着职业的完善性扩充到了800，各种秘技、称号、其他、甚至名胜卡都大大的增加。虽然增加了游戏难度，但也确实增加了可玩性，特别是称号的增多，似乎让玩家有了更多的追求，而“其他”卡片许多与职业相关，增加了其他职业的收集乐趣。名胜卡有32张，奇迹页游，几乎把日本各处的名胜古迹、自然风景全介绍了，在增加游戏趣味的同时似乎真的是种旅游的潜开发。秘技卡与合战卡卡片只是一种形式，实质上是有了该种技能，在战斗中是主动使用式的。

战斗系统

战斗系统包括个人战和合战。整个个人战系统是一种先决互动的模式，随着回合可以增加气力值，气力值可以驱动秘技，而气力的上限又与剑术技能的高低相连。在前面的宝物里讲到了武器的种类划分，并可装备，而装备的效果也体现在了个人战系统中，玩家装备什么武器，那么在战斗中就会确实的使用这个武器，而且每个武器都有不同的攻击模式并有一套特殊的秘技支持（前提是玩家学会了这些秘技）。合战像传统的战棋游戏，玩家按照回合制的规则移动，攻击敌人，使用计略。玩家可以根据兵种的不同，消耗技能点来使用自己的技能卡，如果使用得当就可以轻松消灭敌人，技能点每个回合恢复1点。

建筑系统

《太阁立志传5》有武将、忍者、商人等多种职业，而游戏中的建筑设施也是各式各样，每种建筑的功能也都各不相同。

城是武士们的据点，武士可以在城中进行各类行政类的操作，并且只有武士可以攻占城。